[내일배움캠프] 본캠프 5/28

오늘 한 일

실전프로젝트 데이터 전처리 계속...

가설)

• 글루코오스, 젖산 농도에 따른 pH의 변화가 분화 성공에 영향을 미칠 것이다.
• 전배양 및 첨가물 조건은 분화 결과와 관련 있을 것이다. (Preculture Time, IWP2)

첫번째 가설 쪼금 봣다

 

 

 

 

Glucose(글루코오스) 분포 박스플롯 분석
성공 그룹의 상자(Box)가 실패 그룹보다 아래에 위치한 경우 (Glucose 소모량이 많음)
분화에 성공한 세포들은 초기에 대사 활동이 매우 활발하여 글루코오스를 빠르게 뿜어 쓰며 성장했다는 뜻
특정 일차에 배지 내 남은 글루코오스 농도가 실패 그룹의 중앙값(Median) 이상으로 너무 많이 남아 있다면, 세포가 밥을 안 먹고 있는(대사 정체) 상태이므로 실패할 실험으로 간주하고 조기 중단(Drop)을 고려할 수 있다.
실패 그룹의 상자 길이가 유독 길다면(산포가 크다면), 실패하는 원인이 글루코오스 하나 때문이 아니라 다른 복합적인 요인(예: 첨가물이나 전배양 시간 등) 때문일 확률이 높다

 

 

 

 

Lactate(젖산) 분포 박스플롯 분석
실패 그룹의 상자가 성공 그룹보다 위쪽에 완전히 치우쳐 있는 경우 (Lactate 과다 축적)
젖산이 과도하게 축적되는 현상(Lactic Acidosis)이 세포에 심각한 스트레스를 주어 분화 실패로 이어졌음을 시사합니다. 세포가 정상적인 유산소 대사를 하지 못하고 비정상적인 당분해(Glycolysis)만 급격하게 유도했을 수 있다.
두 박스가 겹치지 않는 경계선, 혹은 실패 그룹 상자의 하단 경계(Q1, 25%선)를 '젖산 마지노선(Upper Limit)'으로 설정할 수 있습니다. 공정 초기에 이 수치를 넘어가면 배지를 강제로 교체(Perfusion)하거나 실험을 멈추는 기준이 된다.

pH 분포 박스플롯 분석
만약 두 그룹의 상자가 세로로 거의 겹치지 않고 확연하게 층이 나뉘어 있다면(예: 성공은 7.2~7.4 사이, 실패는 6.8 이하), pH는 분화 성패를 가르는 강력한 핵심 공정 변수(CPP)로 확정할 수 있다.

 

 

t검정도 해봤는데 p-value가 이상하게 너무 작게 나와서 보니까 시계열 데이터라서 그런거같다고 함